有权制定税收规范性文件的税务机关，应当对税收规范性文件进行清理。清理采取日常清理和定期清理相结合的方法。日常清理由税务机关业务主管部门负责，业务主管部门应当根据立法变化及税收工作发展需要，对税收规范性文件随时进行清理。定期清理由法规部门负责牵头组织，法规部门应对业务主管部门提出的文件目录及清理意见进行汇总、审核。
有权制定税收规范性文件机关的业务部门和法规部门分工合作，定期清理税收规范性文件，及时修订和废止与税收法律法规和税收政策相抵触的有关文件，清理后要及时向社会通报清理结果公布现行有效的规范性文件目录。制定机关应当及时公布日常清理结果，并在定期清理结束后统一公布失效、撤销、废止的文件目录或条款。
